JWMVS-529 CD多变量SSE分析程序

介绍

蛋白质或肽的功能与其结构密切相关。由于CD测量探针氨基酸结构变化,CD广泛用于配制用于药物用途的蛋白质和肽分子的结构分析。CD光谱形状反映了蛋白质和多肽中二级结构基序的丰度比,并且CD数据的二级结构分析提供了这些结构的变化的快速和准确的指示。

JWSSE-513蛋白二级结构分析程序使用经典**小二乘法(CLS),包括Yang1和Reed2的参考谱集。Yang参考光谱从蛋白质的CD光谱中提取,并且**适合于蛋白质二级结构分析。另一方面,Reed参考光谱从肽的CD光谱提取,并且适合于肽的二级结构分析。由于在蛋白质而不是肽的CD光谱中观察到的芳族侧链残基带,两个参考光谱是分开的。

JWMVS-529多变量SSE分析程序包括26个蛋白质CD谱(176-260nm)的库,其使用基于由JASCO创建的光谱的校准模型。包括**新的多变量分析方法和主成分回归(PCR)方法的部分**小二乘法(PLS)方法。在PLS和PCR方法中,光谱依赖于确定浓度的一些潜在因素。为了使浓度的残留误差**小化,计算二级结构的丰度比。这显着提高了β片层基序的分析**度,其没有强的特异性CD标记带。

本应用笔记强调了JWSEE-513和JWMVS-529二级结构分析程序的特性。

本应用笔记将通过测量四种蛋白质的CD光谱来证明一滴微量取样盘的容易性和效率。

**词

二级结构分析,多变量,PLS法,PCR法,JWSEE-513,JWMVS-529,生物化学

特征

  • 与传统上用于蛋白质二级结构分析的CLS方法相比,PLS和PCR方法是更加**的多变量分析方法
  • 使用交叉验证验证校准模型(图1)
  • 编辑二级结构和参考光谱的比率
  • 使用F检验验证分析结果
  • 重新计算和计算结果的验证(符合GLP / GMP)
  • 符合21 CFR Part 11
  • 包括26种蛋白质的CD光谱(176-260nm)和基于那些光谱的校准模型
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